Gli affreschi sopra la galleria dietro l'attraversamento nella navata della chiesa superiore mostrano lo stile inconfondibile di Jacopo Torriti che è stato scelto da papa Nicola IV per la decorazione a mosaico delle tribune apsidali di San Giovanni Laterano (1291) e Santa Maria Maggiore (1296) a Roma. Gli affreschi di Assisi sono prima dei mosaici romani, come è chiaro dal loro approccio più antico alla rappresentazione dello spazio. Il programma decorativo nella navata consiste nel ciclo di affresco La leggenda di San Francesco dipinta da Giotto sotto la galleria nella parte inferiore del muro, e gli episodi del Vecchio Testamento sopra la galleria nel clero sulla parete nord, e gli episodi del Nuovo Testamento sulla parete sud. Alcune di queste scene e la volta con i Deesi furono dipinte da Torriti e dai suoi assistenti. L'immagine mostra la decorazione sulla parete nord (a destra dall'ingresso).